近日,厦门大学信息学院姚俊峰教授团队的一篇论文被国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 录用,Briefings in Bioinformatics是CCF B类期刊,影响因子8.990。该论文是利用3D结构进行分子属性预测的最新研究成果,是由厦门大学、德睿智药和湖南大学联合发表于Briefings in Bioinformatics的文章。

分子性质预测是药物发现领域的关键任务之一。传统方法基于化学家或药学家的经验,并依靠模拟和实验来了解药物的性质。基于深度学习的数据驱动的计算方法加速了药物的开发和发现,并促进了对新药特性的预测。该论文提出基于分子几何学的spatial-temporal gated attention模块的Drug3D-Net模型——一种基于3D药物分子表征的分子性质预测模型。Drug3D-Net有效抽取分子空间结构特征,提高了分子性质预测的准确性,模型的快速收敛大大减少了训练时间和内存的使用量。大量的实验表明,与目前最先进的模型相比,我们提出的方法在四个分子数据集上都取得了优异的预测结果。

该项目得到了国家自然科学基金(No.62072388),福建省科技计划工业引导性项目(No.2020H0047),福建省自然科学基金(No.2019J01601),福建省科技计划创新资金项目(No.2019C0021)。